《北京大學學報（醫學版）》（原名：北京醫科大學學報）創刊於1959年，2001年改為現名，雙月刊。本刊由北京大學主辦，是國內外公開發行的綜合性醫藥衛生學術期刊，連續三屆榮獲「中國百種傑出學術期刊」獎。被美國醫學文獻分析和聯機檢索系統（MEDLINE/PubMed）、美國化學文摘數據庫及其《化學文摘》（CA）、世界衛生組織《醫學增補文摘》（ExtraMED）和俄羅斯《文摘雜誌》（P）收錄。是中國科技論文與引文數據庫（CSTPCD）、中國科學引文數據庫（CSCD）、中國核心期刊要目總覽（第4版）、中國生物醫學文獻數據庫（CBMdisc）和中國生物醫學期刊文獻數據庫（CMCC）核心期刊。也是《中國醫學文摘》、《中國生物學文摘》和《中國藥學文摘》收錄期刊。本刊全文入編萬方數數字化期刊全文數據庫、中國期刊網和中國學術期刊（光盤版）全文數據庫。
《北京大學學報（醫學版）》報道基礎醫學、臨床醫學、預防醫學、藥學等領域的新成果、新技術、新經驗。主要欄目有述評、專家筆談、論著、技術方法、疑難/罕見病例分析、病例報告、短篇論著、綜述、講座、學科交叉等。編輯部主任：曾桂芳。
