《北京大学学报（医学版）》（原名：北京医科大学学报）创刊于1959年，2001年改为现名，双月刊。本刊由北京大学主办，是国内外公开发行的综合性医药卫生学术期刊，连续三届荣获「中国百种杰出学术期刊」奖。被美国医学文献分析和联机检索系统（MEDLINE/PubMed）、美国化学文摘数据库及其《化学文摘》（CA）、世界卫生组织《医学增补文摘》（ExtraMED）和俄罗斯《文摘杂志》（P）收录。是中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）、中国科学引文数据库（CSCD）、中国核心期刊要目总览（第4版）、中国生物医学文献数据库（CBMdisc）和中国生物医学期刊文献数据库（CMCC）核心期刊。也是《中国医学文摘》、《中国生物学文摘》和《中国药学文摘》收录期刊。本刊全文入编万方数数字化期刊全文数据库、中国期刊网和中国学术期刊（光盘版）全文数据库。
《北京大学学报（医学版）》报道基础医学、临床医学、预防医学、药学等领域的新成果、新技术、新经验。主要栏目有述评、专家笔谈、论着、技术方法、疑难/罕见病例分析、病例报告、短篇论着、综述、讲座、学科交叉等。编辑部主任：曾桂芳。
