奧貝隆社廢坑的位置在諾依修塔特的西北一點，不用走多久就可以到達。進入坑道後來到二層，發現一部機械停止了運作，這時，要到一層去尋找動力源。還有在剛進入坑道的右邊，沙土擋住了去路，需要找到炸彈來將沙土炸開。從中間的道路進入，前進不多久，大家找到了動力源，然而啟動這一裝置需要200枚LNCE，由於最多只能攜帶100枚LNCE，所以先將身上的LNCE放入啟動裝置中，剩下的就可以通過在洞內尋找以及戰鬥的方式來獲得了。這樣，成功開啟啟動裝置後，停止運作的機械就被開動了，回到那裡，在提示位置按下○鍵（一次即可），分別搬動機械中部、下部的把手，這樣，如果在這之前曾把坑道內部的鐵板順水推下來的話，到一層就可以順利取得炸彈了。將炸彈推到沙土上，使用戒指點燃炸彈就可以炸飛沙土了。通過這裡到達二曾，發現有一處牆壁壞掉了，這時需要用炸彈把它破壞，先將左下的移動木版切換到隔壁房間的位置，再次回去啟動炸彈生產裝置，再回來取得炸彈，放到壞牆下，點燃，即可通過。進入後，發現了寶箱，原來所謂財寶是一種特殊礦石，為了保持礦石的穩定，所以才要放到寶箱內，而這種礦石，就是過去天空都市所使用的武器的能源。莉阿娜看見深處很光亮，於是大家走上前去，這裡的岩石上，刻著奧貝隆諾依修塔特支部部長，依蕾奴的遺言：「在這裡發現的礦石，可以使生產簡便化，可以讓人們更好的生活，這是神賜予我們的禮物，所以我們要保護這裡，這樣，也就等於保護了諾依修塔特的人們。」……看樣子，現實經常與人的意願相違背呢……
#諾依修塔特
回到商人的家，將寶物給他，得到了3000加路德的報酬，同時，凱伊路等人也裝做什麼都不知道。此時，鬥技場也可以進入了，現在如果有LV20的水平，就可以進去挑戰最初級模式，勝出後，可以得到冰雪之魔劍—。這時回到碼頭，船已經修好了，與船長寒暄後（好有趣的老頭子……-
-）就可以出發了。目標：哈依帝魯貝爾（）城！
#聯絡船
一覺醒來，羅尼與朱達斯不見了，出去走走，發現這兩個傢伙在前甲板上說著什麼。原來，他們又在吵架，因為朱達斯很多事情都瞭解，所以，羅尼一直都在懷疑他接近凱伊路是有某種目的，看見此情此景的凱伊路急忙上前阻止，結果莉阿娜也從桅桿後面走了出來，原來她和羅尼是一種看法……「船到岸後，我就會離開的。」朱達斯拋下這麼句話跑開了。在第二層甲板上，凱伊路找到了朱達斯，凱伊路告訴朱達斯，即使他的一切都是秘密，凱伊路也很高興能和他在一起，畢竟大家是同伴嘛。終於，船就要靠岸了，而羅尼與朱達斯也消除了隔閡，但是，朱達斯自稱精神年齡較高這一點又另羅尼產生了不滿：「你這意思，和你相同年齡的我，就是小孩了！？」……
下船後，離開蘇諾弗裡亞（—），向西北前進，就可以到達哈依帝魯貝爾城了。
#哈依帝魯貝爾城
進城後徑直向前走，就可以進入城堡，開始，被衛兵攔在門口，因為凱伊路等人沒有預約，但是，當衛兵得知凱伊路是斯塔恩的孩子時，則立即通報給伍德洛，這樣，凱伊路等人就順利的受到了英雄王——伍德洛的接見（朱達斯離開隊伍）。走到國王的接見之間的門口是時，，竟然遇見了聖女艾爾琳，艾爾琳也很高興的樣子，她是來邀請伍德洛給予幫助，然而，無德洛沒有答應，具體是什麼事情不太清楚，但是很顯然，艾爾琳並不打算放棄。終於見到了伍德洛，但是凱伊路卻緊張的夠戧，羅尼提醒凱伊路要冷靜。伍德洛提出凱伊路等人沒有按照順序接受接見的事情，凱伊路與羅尼有些害怕，以為會受到懲罰。沒想到的是，伍德洛承諾大家以後任何tine都可以來找他，以為既然是戰友斯塔恩與露荑的孩子，也就等於是他的孩子一樣。（伍德洛確實是一位即威嚴又風趣的人，王者風範哪！）伍德洛知道凱伊路等人從庫雷斯塔不遠千里來到這裡，一定是有重要的事情，所以就直接問了出來，凱伊路告訴了伍德洛事情的原委，然而伍德洛也不是莉阿娜所要尋找的英雄，伍德洛告訴莉阿娜：「要有一顆永不放棄的心。」這時，羅尼提出了艾爾琳來過的問題，原來，艾爾琳是向伍德洛借LNCE的，但是伍得洛並沒有同意，大家來到王座後面的密室，這裡的LNCE竟然堆積成了小山……
出來後，遇見了朱達斯，朱達斯一語見破的說出了這裡的人只因為凱伊路是斯塔恩的孩子才對凱伊路這麼好，如果不是因為父親的名號，恐怕事情沒有這麼順利……這樣的話，使凱伊路受到了打擊，一個人跑開了（雖然是實話，但是也有夠沒方式方法的了……我們單純的主角這下子……），莉阿娜也追了出去。看到沮喪的凱伊路，莉阿娜提出一起散步，凱伊路答應下來，兩個人一起向公元走去。看到外面白雪皚皚，莉阿娜感到不知以後應去往何方，而凱伊路則因為不知道前方有什麼在等待而興奮的不得了，看到這樣的凱伊路，莉阿娜也感到高興，正在這時，一隻飛行龍襲擊了王城的鍾塔，迅速返回王城，剛進入城堡，就聽見一聲士兵的慘叫，同時，怪物也出現了……看樣子，並不是以外，而是直接朝著伍得洛來的，擔心伍得洛的大家，直接衝向接見之間，途中，有BOSS阻擋，敵人具有屬性耐性，很不好對付，最好經常使用攻擊晶術。來到接見之間，再次遇見了巴魯巴托斯，這次果然是來攻擊伍德洛的……這時，聖女艾爾琳出現了，原來，艾爾琳也是幕後的黑手，羅尼憤怒至極，但是卻被艾爾琳的護衛擋住，無法接近，朱達斯想趁機偷襲，靠近艾爾琳是卻被某種力量振飛，而羅尼也被擊飛出去，這時，艾爾琳展開時之空間，要莉阿娜消失掉，凱伊路等人也追進入了空間……
～10年後的世界～
#艾古雷提
莉阿娜告訴凱伊路這是10年後的世界，苯頭苯鬧的凱伊路起初還不肯相信，當看到廣場中央的佛露拖娜女神像後，才明白這一切都是事實，跟著路人進入神殿，觀看出產式（其實就是生孩子），然而竟然是直接從光芒中誕生出嬰兒，而且嬰兒的名字被強制叫做J-237，更過分的是，孩子的父母只有3年的撫養期限，而且孩子的父母也叫做E-102與G-113這樣的怪名字……原來，現在的人沒有自己的名字，而是按照出生的順序進行的編號，這時，出現了一位少女：「你們一定認為這很奇怪吧？對不起，這裡就是這樣呢，一點也不讓人開心。」原來羅尼與朱達斯被傳送到少女的村莊，正在尋找凱伊路和莉阿娜，「不一起去我的村子嗎？這樣就可以見到你們的同伴了，我叫娜娜莉，請多關照。」
#艾古雷提港
到碼頭買船票，得志自己去的地方是一個不服從佛露拖娜神意志的村子，而且粗暴的人也很多（這樣最好，看你們就不順眼）。在二層甲板上遇見莉阿娜，原來莉阿娜也是這個世界的人，凱伊路雖然想為出個究竟，但是看到莉阿娜不願意提起這些事，也就打住了，在凱伊路回去後，娜娜莉發現了莉阿娜的真實身份，但是莉阿娜卻要求娜娜莉保密。「這件事不想讓凱伊路知道，但是總有一天他會知道的，那時候，我……」莉阿那自言自語著。到達切裡克港後，整理過裝備，就向西北的希特裡巴（——）出發了。
#希特裡巴
由於原因不明的溫度變化與河水的上漲，本來的橋現在是不能過了，凱伊路一行人在娜娜莉的建議下，準備繞到上游去看一看究竟發生了什麼。來到上游，明白河水上漲的原因是因為防止水流傾瀉的岩石被衝垮了，只要在把岩石放好就可以了，這樣，就可以過橋了，當然，還要進行BOSS戰，敵vrst始強大了，這一戰，凱伊路無論如何也要保持在最前方，決不能自己後退，回復交給莉阿娜，千萬不能鬆懈。
#霍普湯（—）
離開希特裡巴向西北前進，到達霍普湯。一進村子，就聽見羅尼在大叫，凱伊路急忙上前查看，原來朱達斯也在這裡，孩子們一定要讓羅尼與朱達斯發出尖叫，否則就用晚飯來威脅，這時，娜娜莉招呼他們兩個，轉過頭來，開間了凱伊路，羅尼激動不已，還好這些孩子比較聽娜娜莉的話，羅尼與朱達斯逃過一劫（在我看來，其實凱伊路也很危險……）。在街中散步，路過目的時，看見娜娜莉正在和墓碑交談，原來，這是娜娜莉弟弟的墓，弟弟得了絕症，雖然靠佛露拖娜的力量可以治好，但是條件是把自己的人生交給佛露拖娜。為了能夠活得像人，娜娜莉與弟弟都決定不順從佛露拖娜，這樣就來到了霍普湯，很快，弟弟死去了，但是在者短暫的時間裡，姐弟倆生活得很快樂，到現在，每次出去遇見高興的事情，娜娜莉都會回來講給已死的弟弟聽……
在雜貨屋的交談中，莉阿娜感到凱伊路與她的想法完全不一樣，所以感到很迷茫，即便是在娜娜莉家吃飯，面對娜娜莉做的一席美味佳餚，莉阿娜也有些食不下嚥，看到這裡，凱伊路詢問莉阿娜原因，但是莉阿娜卻隱藏了理由，同時，朱達斯也提出了回到過去的事情。如果回到過去，必須要依靠LNCE的力量，而在卡爾比歐拉（）應該可以找到方法，於是，大家決定去卡爾比歐拉一趟。
#托拉修馬丁（）山
由於現在的卡爾比歐拉被稱為聖地，所謂聖地，一般人當然是沒有理由進去的，所以凱伊路等人只有一條可以到達卡爾比歐拉的途徑，那就是翻越被人們稱為垃圾山的托拉修馬丁山。通過地下的瓦斯地區，這裡要一邊小心瓦斯的傷害一邊推開岩石，隨後通過橋到達一個設置了開門迷題的地區，紅色的按鈕代表數字一，綠色的按鈕代表數字3，藍色的按鈕代表數字5，門上會顯示相應的數字，例如，如果是8，那麼就按動綠色與藍色的按鈕；如果是1，則只按動紅色的按鈕；如果是9要將三個按鈕全部按下。只要按鈕所代表的數字與門上的數字相等，那麼門就會打開。這樣，就通過了「垃圾山」。
#聖地卡爾比歐拉
經過了艱難險阻，到這裡，只要對準機械按下戒指的R2鍵，就可以回到過去了！（進入內部，發生戰鬥，戰鬥結束後進入上方的房間）在這裡，大家見到了真正的神，同時也知道了莉阿娜的真實身份。……
#哈依帝魯貝爾城
回到哈依帝魯貝爾城，大家擔心伍德洛的安危，所以立即進入了接見之間，還好伍德洛並無生命危險，而艾爾琳在凱伊路等人離開後，也離開了這裡，眾人感到這事有些奇怪，而莉阿娜說靠艾爾琳的力量是辦不到的，正當眾人準備詢問究竟時，伍德洛恢復了意識，並且十分擔心LNCE的事，而一切正如伍德洛所料，所有的LNCE全部消失的無影無蹤。由於伍德洛的身體狀態很差，需要休息，凱伊路等人就暫時在城堡內部的貴賓室（客間）住了下來。晚上，娜娜莉與莉阿娜在公園談話，雖然娜娜莉說了很多，但是，並沒有改變莉阿娜的心意……第二天一早，莉阿娜不見了，於是，大家先去找伍德洛尋求幫助。據衛兵的報告來看，莉阿娜已經離開了這裡，朱達斯認為莉阿娜是打算自己去阻止艾爾琳的野心，所以，大概是去了艾古雷提，但是由於莉阿娜的不辭而別，使凱伊路受到了巨大的打擊，這時，朱達斯告訴凱伊路他曾有過相同的經歷，當時，他害怕了，所以，最後能做的事只有自己戴上假面生存：「別害怕，凱伊路，前面有你要尋找的東西。」……「我，也許已經不是必要的了，不是英雄的我，對於莉阿娜來講已經沒有存在的必要……但是，即使這樣……我也要去救莉阿娜！」終於，在大家的勸導下，凱伊路想通了，於是，大家準備直奔艾古雷提，救出莉阿娜。這時，伍得洛對凱伊路說：「請稍等，凱伊路，你想成為你父親那樣的英雄吧，英雄是拯救整個世界的人；現在，事情已經演變成阿塔摩尼神團與各國之間的政治問題，如果你們就這麼去的話，那樣一定會引起戰爭，導致生靈塗炭，這樣，不是和英雄所做的事完全相反了嗎？」「伍德洛叔叔，我認為不是這樣的，每個人都有自己最重要的人，如果連這也不能保護，那英雄又從何談起呢，所以，我要去，去保護莉阿娜！」「怎麼樣也要去嗎……對不起，凱伊路，我只是想試試你的決心。」伍德洛將敕令書交給了凱伊路：「去吧，凱伊路，去成為莉阿娜的英雄吧！」
來到外面，眼看時間趕不及了，這時朱達斯提議，可以先去天地戰爭時的地上軍處點基地，位於王城西南，這樣應該會找到更快到達艾古雷提的方法。
#地上軍處點基地
在門口，向衛兵出示敕令書後就可以得到進入的許可，朱達斯向衛兵提及依庫西弗斯拉（—）的事情。進入基地後，有一些需要注意的地方，一個是廣場中央有一塊沒被雪蓋住的土地——木之封印；進入右上方入口後內部的將要熄滅的壁爐——火之封印；水晶狀的物質——水之封印；分別要將這三個封印打開後才可以去開啟最後的翼之封印。木之封印只要從門口處的休憩所中取得門左側的種植物拿到木之封印所在位置調查即可；火之封印要在基地內部尋找木材，然後放入壁爐中，用戒指點燃；水之封印用戒指連續攻擊三次就可以解開。當三個封印解開後，從廣場進入基地上方的入口，直接把石像推到翅膀的位置上即可。這樣，所有封印解開後，就可以前進了。原來，之前朱達斯提到依庫西弗斯拉是天地戰爭時代製造的飛行艇，駕駛它，就可以很快到達艾古雷提了！
#艾古雷提
剛從飛行艇下來，就被衛兵發現，開始了戰鬥……另一方面，莉阿娜已經被艾爾琳抓了起來，艾爾琳正在對莉阿娜講述著她那瘋狂的夢想……一口氣衝進大聖堂，與艾爾琳戰鬥，注意讓其他角色多使用攻擊晶術，在艾爾琳出現破綻的一瞬間凱伊路發動攻擊，否則得不償失。終於，兩個人再度走到了一起，「你是我的英雄……」莉阿娜這樣說著……大家決定去追逃走的艾爾琳，衝出大聖堂，一個聲音叫住了凱伊路，原來是菲莉婭，她發現研究用的LNCE全部不見了，原來是艾爾琳為了讓神降臨，所以要借助LNCE的力量，並且將所有LNCE裝上飛行龍一併帶走了，菲莉婭送給了凱伊路可以發現隱藏物品的戒指（L2鍵）。於是大家迅速回到屋頂，乘上飛行艇追逐飛行龍。
進入飛行龍內部後，去路被封住了，為了打通道路，必須要破壞4個封印，首先來到左側的房間，這裡是飛行龍的腸道，行走的地方很滑，一不小心就會掉進胃液中……其實有個很簡單的方法，就是連續的故意滑落幾次這樣，就由大姐娜娜莉代勞了。到達製作御室後卻什麼也看不到，這時，只要按下L2就可以發現了。
右方的房間內不滿了細胞組織，在畫面的右邊可以發現一個不停跳躍的細胞，只要用R2將它破壞即可從上方的通路進入制御室。
右下方的房間需要用L2才可以找到通路，進入後，要靠回收與設置梯子才可以前進，能給大家的提示只有四個梯子，應該從畫面上方去設置，梯子設置後，也可在上方回收。
最後一個制御室要從傳送點來到外面，通過另一個傳送點就可以到達，沒有迷題。
終於開啟了大門，繼續前進會有BOSS戰，最好提前補充道具與體力（到開始的位置登上鎖鏈即可）。基本沒有太大難度。戰鬥後，飛行龍由於失去了LNCE的力量開始墜落，這時，要在限制的時間內離開飛行龍，只有從有梯子的房間才可以離開，途中，需要用L2打開備用電源及右上方的緊急出口才可以離開。好容易離開了飛行龍，竟然又再次出現了時空的歪斜……
醒來後，凱伊路等人也不知道自己究竟是在哪裡，從山洞內出來，竟然看見了空中都市！！原來這一切都是艾爾琳為了達到自己的目的而一手造成的。走出海之洞窟，向目標地點前進。
#蒼天都市班傑羅（）
進入城市後，發現這裡的人頭上竟然鑲嵌著LNCE！當然這裡的人見到凱伊路等人也十分奇怪，正當無可奈何時，朱達斯扮失憶的假像來騙取情報……從畫面右方的傳送點來到城市的的二層，走進上方的入口，在這裡稍微休息了一下，大家決定去其他城市看一看，以便收集情報。
#未開之森
離開蒼天都市後一直向西可以到達紅蓮都市。但是途中必須經過未開之森，這裡，有些地方需要用戒指將雜草點燃才可通過，但是在出口前，一種有毒的植物擋住了去路，靠照射所產生的火焰根本不足以將其燒盡，娜娜莉告訴大家，要找到一種叫做的野生動物，取得它的牙齒後就可以點燃這片植物，於是，返回剛才的地區，開始了抓行動，總共5只，需要用L2調查相應位置挖洞，在把擋住水流的岩石挪開，這樣再把一隻一隻的趕入洞中，慢慢走過去，差不多就要踩到它時按○鍵，這樣就可以與它戰鬥，勝利後得到它的牙，戰鬥中盡量使用莉阿娜的水魔法，這樣可以很輕鬆的戰勝。隨後就可以走出森林了。
#紅蓮都市斯貝蘭薩（）
來到二層走到突出的平台，看到了地圖，原來，這個世界是天地戰爭發生之前的世界，看到還有更大的城市雷阿路達（）存在，大家決定去那裡收集情報。向東南走，到達白雪的世界，就會看見黃昏都市雷阿路達，這裡就是哈依帝魯貝爾城的前身。
#黃昏都市雷阿路達
當凱伊路向居民詢問伍德洛英雄王的事情時，人們竟然告訴他，英雄王叫做巴魯巴托斯！！來到廣場，發現有一個閃爍著燭光的地方，這裡就是圖書館——資料室，利用L2就可以進入，然後在下面中間的台座位置調查，這時就出現了影像歷史資料，講述了艾爾琳是如何拯救世界的……「這樣的世界，沒有戰爭，沒有災難，人們與幸福為伴，不是很好嗎？如果可以這樣和凱伊路在一起的話……」莉阿娜這樣說著。「你在說什麼！？莉阿娜！這樣的世界！我不要！這樣的世界，父親、母親、菲莉婭阿姨、伍德洛叔叔都會消失的！這樣的世界……我是絕對不會喜歡的！！」凱伊路的眼中閃爍著異樣的光芒，朱達斯也在一旁靜靜的說道：「沒有歷史的世界，不，是人類否定歷史存在的世界……即使只有一點，我也不會原諒的！」看到大家都這麼堅決，莉阿娜也明白了自己的想法是錯誤的……正當大家考慮要如何回到過去時，從外面傳來了艾爾琳的聲音，大家立刻衝了出去，外面，伴著艾爾琳的聲音，閃爍著LNCE的光芒，而人們也因此得到了力量。原來，現在的艾爾琳居住在空中都市，到達空中都市必須要通過光之祠，所以，向光之祠出發吧！
去光之祠要登上黃昏都市雷阿路達西北的山道才可以到達，有些不好發現，在雪山上看見蜿蜒的黑色就是了，直接登山即可。
#光之祠
凱伊路等人不顧衛兵的阻止直接走上傳送點：「聽得見吧艾爾琳，我們不會逃跑也不會隱藏，把我們帶到空中都市去！」於是，眾人到達了空中都市戴庫羅伏特（），剛剛來到這裡，就遇到了強敵，為了不同的理想，這一仗不可避免，戰鬥開始後，應手動會使用強力攻擊晶術的角色，並隨時注意回復，敵人很強，要千萬小心。戰鬥結束後一直前行見到艾爾琳……原來，朱達斯就是凱伊路的舅舅——里昂（＝）！隨後，艾爾琳將所有人都關入了夢中世界，事實上，艾爾琳所講的幸福，就是將所有的人封閉在夢中世界，永遠不會醒來，這樣，幸福就可以變成永恆了。
隨後，操縱莉阿娜來到夢中世界的庫雷斯塔，遇見了夢中的凱伊路（童年），在莉阿娜的真情呼喚下，凱伊路恢復了神志，同時羅尼也被凱伊路喚醒，這時，凱伊路曾經夢見的場景再次出現在眼前……「斯塔恩叔叔就是這麼被巴魯巴托斯殺掉的，如果當時我不靠近巴魯巴托斯的話……」羅尼一直因為這件事而後悔不已：「我們認為不讓凱伊路知道這事比較好，所以一直隱瞞著……對不起凱伊路！我……我……」羅尼掉下了眼淚……「謝謝！」「誒？」「如果當時羅尼不在，我也不會活到現在，是羅尼保護了我。」「凱伊路？」「而且，父親的事情，也一定是和媽媽一起決定的吧？為了不讓我受到傷害，不讓我悲傷，所以，我要謝謝」「凱伊路……！」羅尼激動得抱住了凱伊路，凱伊路也掉下了眼淚：「父親……已經不在這個世上……有點……真的有點悲傷……但是，以為羅尼還在，所以，沒關係！」「放……放……放心吧凱伊路，我會保護你的！也會連斯塔恩叔叔的分一起補回來！」……隨後是娜娜莉與朱達斯的夢，都是很感人的情節呢……
#[地上軍處點]
為了阻止艾爾琳的野心，凱伊路等人回到了天地戰爭時代……
到了這裡，看到一個奇怪的人正在追逐一部奇怪的機械，而機械似乎很不聽她的話，結果，時間把凱伊路等人也牽扯了進去……BOSS戰，過分的是，這個傢伙被打倒時會自爆，如果沒有及時躲開……更過分的是，我們幫助了那個奇怪的人，她竟然恩將仇報的踢了羅尼一腳，聲稱是因為我們弄壞了她的HRX-2……（！！！）原來這個人就是天才科學家哈羅露特（我們乘坐的飛行艇就是她的傑作），在哈羅露特的帶領下，大家進入了會議室基地的最上方，為了見到艾爾琳，大家加入了地上軍，新兵入伍後，第一件要做的事竟然是撿垃圾……
#物資保管所
一頭霧水的眾人跟著哈羅露特來到了基地東邊的物資保管所，發現這裡竟然有瓦斯從內部冒出，進入保管所後最多只可以停留10分鐘，首先需要製作[——]，製作[——]必須先找到[]、[]、[—]這三樣道具，使用L2。[]在從入口開始的地下，[]在從入口位置計算二層右下的房間裡，[—]在從入口計算最深處二層右下的房間裡，隨後，回到一層入口附近製作[——]，同樣要使用L2；這時可以先出去透口氣，這樣回來的時候還會是10分鐘的時間（注意，之前與之後都不可以，因為其他道具遇冷會壞掉）。然後，再尋找[—]、[—]，[—]在[]的房間內，[—]在[]的房間內，當所有道具入手後，調查一層最深處的儀器，就得到了要撿的「垃圾」，這時，就可以返回基地了。
#[空中都市戴庫羅伏特]
進入會議室向將軍們報告任務完了，今天就可以休息了，從會議室左側下去，下方左面的第一個房間裡可以休息了。第二天，來到會議室，決定了作戰計劃，而大家都很清楚，這也許會是一次有去無回的戰鬥。一切安排妥當後，眾人一起到達了格納庫（飛行艇的位置）。乘坐突擊艇飛上了空中，抵達了目的地，然而著陸的實在有些難看……發生戰鬥後，哈羅露特發現交戰的怪物並不是這個時代所存在的，也就是說……艾爾琳也來了……
這裡可以稱得上是錯綜複雜，不過好在有路標性質的物體存在，有一種上部成藍色的裝置，走進調查會發生戰鬥，勝利後裝置上會出現提示方向的箭頭，只要按照方向行進，就可以順利到達目標地點，另外，用L2鍵可以確認敵人的視線，只要不被敵人發現，就可以避免路上的戰鬥（像某某諜報遊戲一樣，很有樂趣啊）。下一個任務是從左邊的通路乘電梯到達上一層制御室，破壞制御裝置，使空中都市的機能一時停止，這裡，由於哈羅露特需要5分鐘的時間來破壞裝置，所以玩家需要在這5分鐘內不停的與敵人戰鬥，時間倒計結束後戰鬥就會終止。隨後，就是從抵達空中都市的位置脫出了，原路返回即可。
回到地面，戰果報告完畢後，走到外面，哈羅露特由於製造兵器的必須，要再去物資保管所一次，出發之前記得做好準備。
#物資保管所
在門口，哈羅露特告訴大家，被巴魯巴托斯抓走的愛瓦依特，是迪姆羅斯中將的戀人，大家為此感到吃驚。說完，哈羅露特就進研究所工作了，眾人決定再回去勸說中將一次。
#地上軍處點
大家來到迪姆羅斯中將的房間，要求迪姆羅斯救回自己的戀人愛瓦依特，但是，迪姆羅斯是統率全軍的重要職務，不能以自己的個人感情行動，在這樣的情況下，凱伊路等人毅然辭去了軍隊的職務，去斯巴拉爾凱布（）山營救愛瓦依特。
#斯巴拉爾凱布山
斯巴拉爾凱布山位於基地的西北，一開始，要先從大陸中部前進才可以到達。迷宮本身沒有什麼難度，不過最後的BOSS倒是很棘手，hp有200，000之多，想打倒它可要費一番工夫啊。打倒了BOSS，正當要救出愛瓦依特時，巴魯巴托斯用魔法障壁將大家關了起來，這個卑鄙的小人，竟然想這麼就把大家都殺掉！！這時，迪姆羅斯中將趕到，原來哈羅露特開發出了新兵器，迪姆羅斯正好實驗兵器的性能，但是，迪姆羅斯本身也想親手收拾掉巴魯巴托斯呢，在這樣的一對七的不利形勢下，巴魯巴托斯迅速地逃跑了。
#地上軍處點
回到基地，由於迪姆羅斯擅自行動，所以將會受到懲罰，而這個懲罰，竟然是任命迪姆羅斯為空中都市突入作戰的指揮官（……這不是如魚得水嗎，看來上層是有意這麼決定的）……場所自動轉換到物資保管所，這時，前作中出現的神劍、也就是天地戰爭時代製造的最終兵器——索帝安，現在終於誕生了……自動切換到地上軍處點，向司令報告了兵器開發終了的好消息
#空中都市
成功登陸後，索帝安輕易的將圍上來的敵人盡數消滅，由迪姆羅斯率領的索帝安小隊向深處前進，這時，凱伊路讓哈羅露特和索帝安小隊一起行動，因為在歷史中，哈羅露特的哥哥卡雷爾就是在這一戰中喪生的……哈羅露特沉默了一會：「你是笨蛋嗎？你們的目的，不是修正歷史嗎？」途徑電梯時，會有時間倒計的戰鬥，時間一到，從電梯向下即可，來到制御室前，敵人士兵投降了，可以從他們的身上取得一些裝備，不過都是很垃圾的武器。進入制御室後，與巴魯巴托斯戰鬥，但是這個傢伙在戰鬥結束後，再次逃跑了。下一步，就是衝向王座之間，原路返回到開始的地點，就可以到達了。果然，為了勝利，卡雷爾與敵人同歸於盡了……
由於巴魯巴托斯逃跑了，為了追尋他，凱伊路等人到達了神之眼的時代，18年前的時代，斯塔恩的時代。
#外殼
在這裡，路線看似十分複雜，但是只要向西前進就一定可以到達，路上有不少寶箱。
#空中都市
擊倒看們的雜魚後，與父親相遇了，不知道算不算久別重逢……隨後繼續前進，沒有任何迷題，道路也十分簡單，很快就可以到達神之眼的位置，開始的一幕，索帝安為了毀壞神之眼的故事再重現……這時，可惡的巴魯巴托斯再次出現了，這是與他的最後一次戰鬥，這個傢伙也用出了渾身解數。在這裡，有必要說明一下，這個卑鄙的角色，會在HP剩50000的時候發動特技，無論我方使用攻擊或回復晶術，他都會以高位的攻擊晶術反擊，也就是說，從這時開始，戰鬥中就不能使用魔法了，回復方面使用道具……總之是地獄般的戰鬥，最好有50級以上的水平再去挑戰，戰鬥勝利後，巴魯巴托斯這個變態竟然跳到神之眼上自殺了！？（真狠不得把這個卑鄙的傢伙分屍！！）
～現代～
#哈依帝魯貝爾城
見到伍德洛
向伍德洛報告了LNCE的情況後，回到客室休息了一晚翌日的清晨，凱伊路和莉阿娜又去了公園，談話中，發現了時間的歪曲，這時，羅尼趕來說哈羅露特有事要說，回到了客室，原來，艾爾琳還在進行著她瘋狂的計劃，看來又要出發了啊。
#地上軍處點
來到格納庫，發現飛行艇竟然自己返回了！這樣就向10年後的世界出發了！
～10年後～
#艾古雷提
從士兵口中得志艾爾琳去了聖地卡爾比歐拉，於是到達艾古雷提港乘船前往。
#聖地卡爾比歐拉
進入後來到以前曾有神出現的地方，發現LNCE不見了，艾爾琳一定就在裡面。從這裡進入後繼續前進，到達盡頭的房間後用戒指燒開蜘蛛網就可以繼續前進了。來到最下方，分別在右上、右下、左上、左下分佈著四個房間，分別名為暗、罰、罪、死，首先進入暗，用L2調查房間後方的石碑，然後在用R2鍵按照暗→罰→罪→死的順序點燃房間中央的巨型蠟燭，如果順序錯誤，那麼從房間出來後蠟燭會自動熄滅，切記。完成後，上面的大門就可以打開了從大門進去，就可以看到艾爾琳了，同時進行與艾爾琳手下的戰鬥，這個傢伙總是非在空中，普通攻擊十分不容易命中，最好的方法還是攻擊晶術。終於見到了艾爾琳，原來她想讓巨大的彗星撞擊地球……「悲哀與歡樂都不存在的世界，就是身真正降臨的世界……」艾爾琳這樣說著，凱伊路的怒火已經壓抑不住了：「別開玩笑了！如果一定需要神，我們人類是什麼？人類到底是什麼！？我所看見的，是鑄造起歷史的偉大的人類！用人們的生命來證明的歷史！誰也別想讓它消失！完全的幸福，在這個世界是不存在的！就是因為有了痛苦與悲傷，人們才希望得到幸福！對，是用自己的努力來獲得的！現在我們就打倒你！」「現在即使打倒了我也是沒有用的，因為神已經降臨了。」「那麼……就把神殺掉！然後，讓你不能再次復生！」「看來莉阿娜沒有告訴你真實呢……那麼就由我來告訴你，莉阿娜和我就是神……」「莉阿娜是……神！？」「所以，如果把神殺掉，我和莉阿娜都會死，信不信是你們的自由，但是真實只有一個。」雖然凱伊路等人不願意相信，但是莉阿娜也這樣說著……艾爾琳逃走了……凱伊路知道了真實後陷入了極度的絕望與痛苦中：「回去？回去了以後要做什麼？我不知道……我什麼也不知道啊！」
～現代～
回到現代後，在朱達斯的提示下凱伊路決定去找母親等過去的英雄談話，按照伍德洛、菲莉婭、露荑的順序交談完畢後，凱伊路和莉阿娜一起去拉古娜遺跡散心……路上的敵人很強大，而隊伍裡只有兩名角色，大家要小心。
#神之卵
第二天早上，羅尼喚醒凱伊路，神之卵出現了！大家盛坐飛行艇向西南就可以到達神之卵。神之卵是遊戲最後的迷宮，當然，在難度上就會高出很多，首先，敵人的強大是毋庸置疑的，其次迷宮中的迷題也是著實讓人頭疼，各位玩家在此一定要做好萬全的準備。
進入神之卵後，發現盤旋的道路並不能到達最後，實際上，這是唯一的通路，需要解開三個封印才可以通過。
封印1：利用戒指攻擊有顏色的球體，以此來將相同顏色的路標的方向改變，每個路標上面有著兩個箭頭，讓他們都指向通路，主角乘坐的石板就可以通過，在這裡，不停的變換路標才可以，有些地方的球體是控制兩個路標的，需要注意，沒有任何竅門，不停的嘗試即可通過。
封印2：靠變化身體的大小來尋找通路，同樣的沒有太多的竅門，在這裡提醒大家一下，身體變大，有些地方可以跳躍；身體變小，可以到達身體大時不能到達的地方，也可以變化石板的行動方向；最後，就是自己的眼睛一定要認真的觀察哪裡有可以以小號的身體通過的路。
封印3：這裡是類似飛行龍體內的滑床地區，可惜這次沒有人能幫助玩家了，好在即使掉落下去也可以上來再走一遍，在滑床上，慢慢移動才是最好的方法，不要太心急，沒有任何隱藏的道路。
完成後，最下方會出現通向中部的道路。中部地區是要玩家控制角色一個一個的與自己的回憶戰鬥，首先開始的地區是朱達斯與娜娜莉的回憶，完成後由娜娜莉的回憶房間進入下一地區，這裡是羅尼與哈羅露特的回憶，完成後從羅尼的房間就可以進入凱伊路的回憶房間所在的地區了，當回憶的結晶全部取得後，就可以進入最後一層了。
最後一層沒有迷題，單純的一條路，一直走下去就會到達艾爾琳所在的地方。艾爾琳具備相當強悍的力量，在其HP下降到一定程度時，會引發凍結效果，這時，範圍內的人都會被凍結，行動不能，受到普通攻擊也會喪命，只有一個預防的方法，就是裝備耐寒的道具—，這樣就不怕凍結效果了，然後，要注意艾爾琳的超強魔法，一旦被打中，基本上就可以決定生死了……苦戰後，好不容易打倒了艾爾琳，但是這個時候神出現了……還要與神戰鬥……最後的敵人，只能告訴大家，多用攻擊晶術吧……
